使用 Python 绘制不同尺寸的球——利用Mayavi库
“万恶”的 mayavi 库,琢磨了老半天,才弄清楚怎么根据给定的球心坐标和半径批量绘制出三维空间的球。
1. 思路
mayavi 的 mlab 类似 matplotlib 的 pyplot, 其中points3d
函数用来绘制一些三维空间的离散点,在实际情况中,一个点必然需要一种“表示方式”,在points3d
函数中,提供了"sphere", "point", "cylinder", "cone", "cube", "2darrow", "2dcircle"
等很多模式,即用“球、点、圆柱、圆锥、方块、二维箭头、二维圆”等来表示一个点,当选择"point"
时,往往可能由于点的可视感太低而显示出来的结果“啥都没有”,所以此函数默认的图例模式为"sphere"
。由此引发感想,若可控制每个球的大小,那么不就可以用这些球来表示出自己想画的一些球了嘛。
于是通过研究mlab.points3d()
函数发现,可以传入若干球的球心坐标对应的x,y,z
,以及相应的半径r
,然后设置好scale_factor
、resolution
、mode
参数即可。这三个参数和r
参数的说明如下:
scale_factor
:缩放因子,mayavi 的官方文档说得很含糊,其到底怎么发挥作用的完全没有说清楚,这里经过多次试验总结为:将其设置为scale_factor=1
的话,即会按传入的“大小参数”r
进行一比一缩放,这个参数可视为不存在。resolution
:每一个点(球)的解析度/分辨率,为整数,默认值为 8,默认值为 8 时可明显看出用球表示点时球有“棱角”,这里将其设置为 30。观察这里的坐标,显然,
resolution
参数还会一定程度上影响计算的精度吧,毕竟表面是计算后渲染出来的!咳,这点以后再说吧,目前只是需要绘制图形效果。mode
:其实可以不设置,默认情况即是用 sphere 作为点的的图例,这里拿出来只是作为强调,应该设置为mode="sphere"
。r
:按照官方文档,严格来说这不是r
参数,其形参名为s
,但不管叫什么,它就是表示points3d
函数绘制出来的点的大小的一个参数。这里经过多次试验,发现它的数值表示的“大小含义”,对于mode="sphere"
来说就是球的直径,对于mode="cube"
来说就是立方体的边长,对于mode="cone"
来说就是圆锥的高,对于mode="cylinder"
来说就是圆柱的高。概括而言,在内部实现中,这种对应关系是否有统一理论指导其代码实现尚不得而知。
2. 解决方案
这样绘制你的球:mlab.points3d(x, y, z, r*2, scale_factor=1, resolution=30)
3. 示例
设置一个位于原点的单位球,然后在其上、下、左、右、前、后再各放置 1 个球,检验他们的相切情况。
import numpy as np
from mayavi import mlab
points = np.array([[0, 0, 0, 1],
[4, 0, 0, 3],
[-4, 0, 0, 3],
[0, 2, 0, 1],
[0, -2, 0, 1],
[0, 0, 2, 0.5],
[0, 0, -2, 0.5]])
x, y, z, r = points[:, 0], points[:, 1], points[:, 2], points[:, 3]
mlab.points3d(x, y, z, r*2, scale_factor=1, resolution=30, mode="sphere")
mlab.outline()
mlab.axes()
mlab.show()
4. 附录
4.1. 我本来想要画的球堆积颗粒模型:
4.2. 原本我采用的绘球函数:
若要在一张图上绘制很多球的话,这种方式只能使用 for 循环一个球一个球地进行绘制,效率比较低,硬件成本也比较高。也是为此一直在研究points3d
函数的。
import random
import numpy as np
class Plotter:
random.seed(3.14)
@classmethod
def randomColor(cls):
color = (random.random(), random.random(), random.random())
return color
@classmethod
def sphere(cls, center, radius, nPoints=100, opacity=1.0, color=None):
"""Draw a sphere according to given center and radius.
Parameters:
-----------
center(tuple): (x, y, z) coordinate
radius(float): radius of the sphere
"""
u = np.linspace(0, 2 * np.pi, nPoints)
v = np.linspace(0, np.pi, nPoints)
x = radius * np.outer(np.cos(u), np.sin(v)) + center[0]
y = radius * np.outer(np.sin(u), np.sin(v)) + center[1]
z = radius * np.outer(np.ones(np.size(u)), np.cos(v)) + center[2]
from mayavi import mlab
color = cls.randomColor() if color is None else color
scene = mlab.mesh(x, y, z, color=color, opacity=opacity)
return scene